制藥GMP廠房、乳制品廠房、醫院手術室、生物潔凈、發醇工業等潔凈室和無菌環境中的空氣微生物檢測以及有關研究教學部門做空氣微生物的采樣研究時一般采用浮游菌采樣器。浮游菌采樣器作為一種常用檢測儀器，具有采樣量大、性能穩定、操作簡便等優點，它能夠準地反確映出潔凈室內的微生物濃度，它根據顆粒撞擊原理和等速采樣理論設計，采樣樣式直接能更準確地反映潔凈室內的微生物濃度，采樣口風速與潔凈室內風速基本一致，，采樣時打開采樣頭上密封蓋后直接打開儀器點擊采樣即可，這樣帶塵菌空氣高速通過采樣頭上的微孔，被撞擊在培養皿內的瓊脂表面，這些活體微生物在培養過程中，發生動態再水化過程，高速生長，從而更快得出結果。

    現如今人們對食品安全、醫藥安全的關注度越來越高，所以人們對生產企業和公共機構有更高的要求。制藥企業是在生產企業標準中較為嚴格的的《藥品生產質量管理規范》，簡稱GMP標準。其中，要求同時檢測浮游菌項目和沉降菌項目，這是生產車間空氣潔凈度中生物潔凈要求。其他食品廠、嬰幼兒配方乳制品廠房、醫院手術室、發酵工業潔凈室等也慢慢的從單一檢測沉降菌到更為嚴格的雙向同時檢測浮游菌和沉降菌的GMP標準靠攏。

    我們知道，細菌在空氣中是不能單獨存在的，常附在比它們大數倍的塵粒表面，所以空氣中懸浮或沉降到地面上的細菌非常多。盡管自然大氣中微粒(包括生物微粒)的濃度隨時間、地點不同有所變化，但粒徑分布是大體相同的。因而浮游菌與沉降菌的關系即是浮游的生物粒子與沉降的生物粒子之間的關系，實際上都是帶菌的生物粒子。因而可認為在無風自然大氣中，浮游菌與沉降菌有相關關系，可以利用沉降菌值推算浮游菌的濃度。但生物潔凈室內，不同于在自然大氣中的帶菌粒子的粒徑分布，有多種因素的影響，浮游菌與沉降菌的關系必然不同于自然大氣中的情形。

    浮游菌與沉降菌的關系不可能相一致，在不同用途的生物潔凈室的內部狀況是有差別的。對于食品生產潔凈車間，其生產特性不但使其區別于其它用途的生物潔凈室，而且生產不同食品的潔凈車間，其工藝過程各不相同，所以不能沿用一般生物潔凈室浮游菌與沉降菌的關系來反映制食品生產車間內二者的關系。

    通過浮游菌采樣器對廠房做浮游菌和降沉菌采樣實驗數據中可以得出:

    不同類型的食品生產車間，其浮游菌濃度與沉降菌落數的關系與各自具體的生產工藝、氣流組織形式、換氣次數、人員情況等因素有關，且差異甚大，難以找出共同性的規律，《GMP設計規范》中二者控制指標的關系充分體現了這一點。

    因而，就一般意義講，由于浮游菌濃度與沉降菌落數關系不確定，制藥車間的沉降菌星只能說明其表面微生物的污染狀況;浮游菌量則反映車間內空氣中生物粒子的濃度。對于食品廠、乳制品廠、手術室、發酵工業潔凈室等要全面反映車間內微生物的污染程度，需同時檢測沉]降菌和浮游菌兩項指標。單項檢測不能完全反映車間內的潔凈度。